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實驗室主任

陳松林

陳松林,男,博士,研究員。現任中國水產科學研究院黃海水產研究所水產生物技術與基因組研究室主任,海洋科學與技術試點國家實驗室海洋漁業科學與食物產出過程功能實驗室副主任。兼任中國水產科學研究院水產生物技術領域首席科學家,中國水產學會水產生物技術專業委員會主任委員,山東省海洋漁業生物技術與遺傳育種重點實驗室主任,山東省泰山學者攀登計劃專家;兼任國際刊物Sci Reports和Marine Biotechnology編委,《水產學報》副主編等職務。

主要研究方向包括魚類基因組學、基因資源發掘和分子育種、性別決定和性別控制、細胞培養和種質冷凍保存等。先后主持國家863、973、公益性行業(農業)科研專項、國家自然科學基金重點項目、山東省良種工程等項目40多項。領銜完成了半滑舌鰨和牙鲆等6種海水魚類全基因組解析,發現半滑舌鰨雌性特異分子標記和雄性決定基因,揭示鲆鰨魚類性別決定和變態發育的分子機制;建立了鲆鰨魚類基因資源發掘和分子育種的技術體系,建立了鲆鰨魚類基因組選擇育種技術和基因組編輯技術;發明半滑舌鰨高雌性苗種制種技術;發明魚類精子冷凍保存實用化方法,建立30多種海淡水魚類精子冷凍庫;發明魚類胚胎玻璃化冷凍保存技術,突破海水魚胚胎冷凍保存技術難關;建立23個魚類細胞系;育成牙鲆新品種2個和羅非魚新品種1個。獲國家技術發明二等獎2項(排名1)、國家科技進步獎二等獎1項(排名2)。以第一完成人獲授權發明專利34項。發表論文420余篇,其中,第一和通訊作者SCI論文190多篇,包括Nature Genetics論文2篇,Genome Research論文1篇。主編出版“魚類基因組學和基因組育種技術”及“魚類性別控制和細胞工程育種”等中英文專著5部。獲第十二屆光華工程科技獎、全國首屆創新爭先獎狀、第四屆中華農業英才獎、第三屆中國青年科技獎、國家百千萬人才工程第一二層次人選、農業部和山東省有突出貢獻中青年專家、山東省泰山學者攀登計劃專家等20多項榮譽稱號。

部分代表性論文清單:

  1. Qian Zhou, Zhencheng Su, Yangzhen Li, Yang Liu, Lei Wang, Sheng Lu, Shuangyan Wang,Tian Gan, Feng Liu, Xun Zhou, Min Wei, Guangjian Liu* , Songlin Chen* 2019 Genome-wide association mapping and gene expression analyses reveal genetic mechanisms of disease resistance variations in Cynoglossus semilaevis. Frontiers in Genetics. 10:1167(1-12)

  2. Qian Zhou#, Haoyang Gao#, Yong Zhang , Guangyi Fan, Hao Xu, Jieming Zhai, Wenteng Xu, Zhangfan Chen, He Zhang, Wensheng Li, Weiming Li*, Haoran Lin*, Songlin CHEN*2019A chromosome-level genome assemblyof thegiant grouper,Epinephelus lanceolatusprovides insights into its innate immunity and fast growth. Molecular Ecol Res., 19(5):1322-1332

  3. 陳松林,徐文騰,劉洋2019魚類基因組研究十年回顧與展望。水產學報,43(1):1-14

  4. Yang Liu#, Sheng Lu#, Feng Liu, Changwei Shao, Qian Zhou, Na Wang, Yangzhen Li, Yingming Yang, Yingping Zhang, Hejun Sun, Weiwei Zheng, Songlin Chen* 2018 Genomic selection usingBayesCπ and GBLUP for resistance againstEdwardsiella tardain Japanese flounder (Paralichthys olivaceus).Mar Biotech., 20:559-565.

  5. Zhongkai Cui#, Yun Liu#, Wenwen Wang, Qian Wang, Ning Zhang, Fan Lin, Na Wang, Changwei Shao, Zhongdian Dong, Yangzhen Li, Yingming Yang, Mengzhu Hu, Hailong Li, Fengtao Gao, Zhanfei Wei, Liang Meng, Yang Liu, Min Wei, Ying Zhu, Hua Guo, Christopher H.K. Cheng*,ManfredSchartl*, Songlin Chen* 2017Genome editing revealsdmrt1as an essential male sex-determining gene in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis).Sci Reports,7:42213 | DOI: 10.1038/srep42213..

  6. Changwei Shao#, Baolong Bao#, Zhiyuan Xie#, Xinye Chen#, Bo Li#, Xiaodong Jia#, Qiulin Yao, Guillermo Ortí, Wenhui Li, Xihong Li, Kristin Hamre, Juan Xu, Lei Wang, Fangyuan Chen, Yongsheng Tian, Alex M. Schreiber Na Wang, Fen Wei, Jilin Zhang, Zhongdian Dong, Lei Gao, Junwei Gai, Takashi Sakamoto, Sudong Mo, Wenjun Chen, Qiong Shi, Hui Li,Yunji Xiu, Yangzhen Li, Wenteng Xu, Zhiyi Shi,Guojie Zhang, Deborah M Power*, Qingyin Wang*, Manfred Schartl*, Songlin Chen* 2017The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry. Nature Genetics, 49(1):119-124. DOI.10.1038/ng.3732

  7. 陳松林,邵長偉,徐鵬 2016水產生物技術發展戰略研究。中國工程科學,18(3):49-56

  8. Changwei Shao#, Yongchao Niu#, Rastas Pasi, Yang Liu, Zhiyuan Xie, Hengde Li, Lei Wang, Yong Jiang, Shuaishuai Tai, Yongsheng Tian, Takashi Sakamoto*, Songlin Chen* 2015Genome-Wide SNP Identification for the Construction of a High-Resolution Genetic Map of Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) Applied to QTL Mapping ofVibrio anguillarumDisease Resistance and Comparative Genomic Analysis. DNA Research.22(2), 161–170.

  9. Changwei Shao#, Qiye Li#, Songlin Chen#*, Pei Zhang, Jinmin Lian, Qiaomu Hu, Bing Sun, Lijun Jin, Shanshan Liu, Zongji Wang, Hongmei Zhao, Zonghui Jin, Zhuo Liang, Yangzhen Li, Qiumei Zheng, Yong Zhang, Jun Wang, Guojie Zhang* 2014 Epigenetic modification and inheritance in sexual reversal of fish. Genome Research, 2014, 24:604-615

  10. Songlin Chen#*, Guojie Zhang#, Changwei Shao#, Quanfei Huang#, Geng Liu#, Pei Zhang#, Wentao Song, Na An, Domitille Chalopin3, Jean-Nicolas Volff3, Yunhan Hong4, Qiye Li2, Zhenxia Sha1, Heling Zhou2, Mingshu Xie1, Qiulin Yu2, Yang Liu5, Hui Xiang6, Na Wang1, Kui Wu2, Changgeng Yang1, Qian Zhou2, Xiaolin Liao1, Linfeng Yang2, Qiaomu Hu1, Jilin Zhang2, Liang Meng1, Lijun Jin2, Yongsheng Tian1, Jinmin Lian2, Jingfeng Yang1, Guidong Miao1, Shanshan Liu1, Zhuo Liang1, Fang Yan1, Yangzhen Li1, Bin Sun1, Hong Zhang1, Jing Zhang1, Ying Zhu1, Min Du1, Yongwei Zhao1, Manfred Schartl*, Qisheng Tang* & Jun Wang*. 2014 Whole-genome sequence of a flatfish provides insights into ZW sex chromosome evolution and adaptation to benthic lifestyle. Nature Genetics, 2014,46(3):253-260.

  11. Na Wang, Xian-Li Wang, Chang-Geng Yang,Yu-Xi Zhang,TianZhi Wang, Song-Lin Chen* 2014Molecular cloning and multifunctional characterization of GRIM-19 (Gene associated with Retinoid-Interferon-induced Mortality 19) homologue from turbot (Scophthalmus maximus).Dev Comp Immunol,43(1) :96-105

  12. Chen Song-Lin, Ji Xiang-Shan, Shao Chang-Wei, Li Wen-Long, Yang Jing-Feng, Liang Zuo, Liao Xiao-Lin, Xu Gen-Bo, Xu Ying, Song Wen-Tao 2012Induction of mito-gynogenetic diploidsandidentificationof WW super-female using sex-specific SSR markersinhalf-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis)Mar Biotechnol, 14(1) :120-128.

  13. Chen Song-lin, Li Jing, Deng Si-ping, Tian Yong-Sheng, Wang Qing-yin, Zhuang Zhimeng, Sha Zhenxia, Xu Jianyong 2007 Isolation of female-specific AFLP markers and molecular identification of genetic sex in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis). Mar Biotech, 9(2):273-280.

  14. Chen Song-Lin, Li Wei, Meng Liang, Sha Zhen-Xia, Wang Zhi-Jian, Ren Guo-Cheng 2007 Molecular cloning and expression analysis of a hepcidin antimicrobial peptide gene from turbot (Scophthalmus maximus). Fish Shell Immunol,22:172-181.

  15. Chen SL, Xu MY, Ji XS, Yu GC, Liu Y. 2005 Cloning, characterization and expression analysis of hepcidin gene from red sea bream (Chrysophrys major). Antimicrob. Agents Chemo., 49(4):1608-1612.

  16. Chen S.L., Tian Y.S. 2005. Cryopreservation of flounder embryos by vitrification. Theriogenology, 63(4):1207-1219.

  17. Chen S.L., Xu M.Y., Hu S.N., Li L. 2004. Analysis of immune-relevant genes expressed in red sea bream spleen. Aquaculture, 240:115-130.

  18. Chen S.L., Ren G.C., Sha Z.X., Shi C.Y. 2004 Establishment of a continuous embryonic cell line from flounder (Paralichthys olivaceus) for virus isolation. Disease of Aquatic Organism, 60:241-246. (SCI收錄)

  19. Chen S.L,Ji X.S., Yu G.C., Tian Y.S., Sha Z.X.2004. Cryopreservation of spermatozoa from turbot (Scophthalmus maximus) and application to large scale fertilization. Aquaculture, 236:547-556

  20. Chen, S.L, Sha ZX, Ye HQ. 2003 Establishment of a pluripotent embryonic cell line from sea perch blastula embryo. Aquaculture, 218:141-151

    專著清單:

  21. Han-Ping Wang, Francesc Piferrer, Song-Lin Chen, edited《Sex Control in Aquaculture》, Volume 1 and 2. Wiley Blackwell, 2019,UK

  22. 陳松林主編《魚類基因組學與基因組育種技術》。科學出版社,2017,北京.

  23. 陳松林主編《魚類性別控制與細胞工程育種》。科學出版社,2013年,北京。

  24. 陳松林,秦啟偉主編《魚類細胞培養理論與技術》。科學出版社,2011年,北京。

陳松林主著《魚類精子和胚胎冷凍保存理論與技術》。農業出版社,2007年,北京。

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