“水產動物多性狀復合育種技術”是經過多年研究探索，又經引進、消化吸收和自主創新建立的水產動物遺傳育種技術。該成果得到了國家“863”計劃、“十五”國家科技攻關計劃、農業部優勢農產品重大科技推廣項目、農業部“948”等課題的共同資助。

該技術成果建立了三種育種模式，即精細育種模式、全同胞育種模式和群組育種模式，構建了具有創新特色的水產優良品種培育的技術體系；群組育種模式為獨立創建，主要優點是簡便易行，克服交配不可控制、個體不能標記等問題；制定了水產動物選擇指數的計算方法，實現了多性狀的復合育種。該方法將不同性狀、不同度量單位所得到的育種值轉化為相同等級的純數，提高了多性狀復合育種的選擇效率和準確性。

以建立的“水產動物多性狀復合育種技術”為主要技術依托，研發出“水產動物育種分析與管理系統”計算機軟件（登記號：2007SR08004）。該軟件共7個功能模塊，實現了從良種選育、良種推廣到良種生產追溯等所有環節的標準化和電子化管理；可自動化完成種質和性能測定數據的管理、遺傳參數估計、育種值計算、配種方案制定等主要技術工作。

與國內同類技術比較，該技術成果在以下三個方面優勢顯著：

1. 可同時實施多個性狀的選擇育種，培育具備多個優良性狀的優良品種。對于改良性狀的遺傳力在中等或以上水平（≥15%）的物種，平均每代的選擇反應在10%以上。目前國內水產育種較多地采用群體選育、雜交育種等技術方法。前者難以實現多個性狀的選育，特別對于像抗病（逆）力、出肉率等性狀，測試個體因感染病原或被宰殺而不能留種選育；雜交技術雖然可以同時整合多個性狀，但存在雜種傳代后出現分化問題，優良性狀難以完整、持續地遺傳。

2. 通過5代以上的系譜跟蹤，嚴格控制近親交配，降低了近交衰退的影響。連續選育25代，平均每代的近交率可控制在0.2%以內。國內育種技術一般不采用家系或群組的標記技術，多利用擴大基礎群體的方法控制近親交配和近交衰退，存在一定的盲目性；通過家系標記和計算機軟件制定配種方案可以準確、嚴格地控制近親交配。

3. 建立的良種培育及擴繁體系具可追溯性、可控性、可持續性。

“水產動物多性狀復合育種技術”的主要應用領域為水產動物育種業。凡可在人工條件下繁育、養殖的水產動物，皆可利用該技術同時改良多個性狀，包括生長、抗病、品質及出肉率等；應用單位包括從事水產動物遺傳育種研究的科研院、所，大專院校，水產原良種體系中的遺傳育種中心、良種場，以及水產業其它從事水產生物育種研究的企事業單位。目前該技術已經在中國對蝦、大菱鲆和羅氏沼蝦等育種項目中推廣應用。